藤花落遺址位于連云港經濟技術開發(fā)區(qū)中云街道西諸朝社區(qū)南、北云臺山之間的沖積平原上，面積40萬平方米，發(fā)現(xiàn)于1986年，包含北辛文化、龍山文化、岳石文化時期的文化遺存。藤花落距今4600—4000年，與夏朝基本同時，是我國迄今發(fā)現(xiàn)的首座內外城雙重結構的城址，被評為2000年度中國考古十大新發(fā)現(xiàn)。

歷經1996年至2004年四次考古發(fā)掘，發(fā)現(xiàn)龍山文化的城墻、大型臺基、居住房址、灰坑、用水坑、灰溝、水溝、防護環(huán)城壕、水稻田以及岳石文化的環(huán)壕、灰坑等遺跡，出土玉器、石器、陶器2000多件及碳化稻粒數(shù)百顆。

藤花落古城由內外兩道城垣組成，內城和外城有著功能上的區(qū)別，內城是生活區(qū)，外城是生產區(qū)，所有的房址都在內城之中，東、南、西部內外城之間的距離相當，北部內外城之間有較廣闊的空間。這里是稻作生產區(qū)。藤花落古城內房子基址形態(tài)多樣，分為長方形單間房、雙間房、排房、回字形房，并且在總體布局顯示出差異性。以內城東部的一條東西向的主干道為界，北部房址平面有圓形、梯形、方形，形狀不甚規(guī)矩，房址單間面積比較小，每間面積在5—7平方米；而路南的房址結構考究，皆為方形，除單間外，還有排房，平面較規(guī)整，雙間房和排房的分布規(guī)則基本一致，每間面積在12平方米。在內城居住區(qū)北部發(fā)現(xiàn)一處建在臺基之上的高臺式建筑。此建筑平面呈回字形，外間面積達109平方米，內間面積達31平方米，分為兩層。內間平面上分布三塊巨石，另有一處“暖炕”，專家推測是氏族長老的住所，在此舉行祭祀活動和氏族會議。

在古城南墻和南城門口兩側的城墻夯土中發(fā)現(xiàn)了許多長方形和橢圓形的土坑，其內分別埋置人、豬、狗的遺骸，有的是數(shù)人同埋一坑，當是為建筑奠基的“人牲”和“犧牲”的祭祀坑是原始宗教儀式的遺存。

藤花落古城內不僅有獨特的城墻結構和豐富的遺跡，還有大量珍貴的文物，展現(xiàn)了龍山文化時期的城市面貌和社會生活。

北部內外城之間一號水田遺跡揭露面積約為67平方米，由水田、水口、水溝、石埠頭等組成。水田土壤經江蘇省農科院測試分析，含有大量的龍山文化時期水稻植體。在城外發(fā)現(xiàn)稻及與稻伴生的主要禾本科植物如蘆葦、竹等蛋白質體種類。碳化稻粒經鑒定為岳石文化時期的“優(yōu)選”粳稻，其中一粒金黃色稻粒經檢測與現(xiàn)代粳稻十分接近。

昔日繁華的城市今朝只剩黃土一片，專家推測，藤花落古城消失的原因有兩個：一是洪水和海侵。外城墻發(fā)現(xiàn)洪水沖擊痕跡，有專家認為海水倒灌導致了藤花落的滅亡；二是環(huán)境災難。大量樹木被砍伐，導致環(huán)境惡化，引發(fā)干旱或洪澇災害。據環(huán)境考古學的研究表明，4200年前的龍山文化晚期經歷較長期的陸地水患。藤花落遺址在龍山文化后期出現(xiàn)過長時間的陸相水生環(huán)境。當時的藤花落古城降雨量偏大，處于一種過濕的積水或濕地環(huán)境，氣候異常出現(xiàn)過災難性大水，雖然有城墻保護，卻給農業(yè)生產和狩獵帶來嚴重破壞，先民們不得不放棄此家園。

此外，大量的樹木被砍伐，用來筑城、造屋、燒造陶器或用于日常生活周圍生態(tài)環(huán)境的惡化，引發(fā)了洪澇災害等，人們無法在此生存。